度強光蛍•–宿主の遺伝子蛍蛍光光染染色色、、画画像像取取りり込込みみ&&解解析析各各アアププリリケケーーシショョンンにに特特化化各各アアププリリフフししたたトト解解析析ソソフフトト41例)肝炎ウィルス関連・EBV DNA、CMV DNA ・淋菌及びクラミジアrRNA ・抗酸菌核酸同定・インフルエンザ、SARS コロナウィルス・HTLV-1、HIV-1 ・HPV ジェノタイプ・薬剤耐性遺伝子・MRSA、新型コロナウィルス例)各種遺伝学的検査PPCCRRでで増増幅幅ししななかかっったたサイクル数•ターゲットと同一プライマー領域を持つIC特異的配列プライマーを用いて増幅検出する蛍蛍光光染染色色、、画画像像取取りり込込みみ&&解解析析各各アアププリリケケーーシショョンンにに特特化化各各アアププリリフフししたたトト解解析析ソソフフトト参照:「遺伝子関連検査検体品質管理マニュアル」平成28 年度「臨床検査における品質・精度の確保に関する研究」(厚生労働行政推進調査事業費補助金(厚生労働科学特別研究事業))報告書より一部改よりササンンププルル、、反反応応液液調調製製PPCCRR反反応応ゲゲルル電電気気泳泳動動ササンンププルル、、反反応応液液調調製製PCR反反応応蛍蛍光光検検出出•定性解析•定量解析ササンンププルル、、反反応応液液調調製製PPCCRR反反応応ササンンププルル、、反反応応液液調調製製PCR反反応応病病原原体体核核酸酸検検査査::病原体(ウイルス、細菌等微生物)の核酸(DNA / RNA)を検出・解析する検査体体細細胞胞遺遺伝伝子子検検査査::疾患病変部・組織に限局し、病状とともに変化する一時的な遺伝子情報を明らかにする検査例)癌関連遺伝子検査・白血病・悪性リンパ腫関連遺伝子検査・Major BCR-ABL1 変異解析・WT1mRNA ・免疫関連遺伝子再構成・EGFR 変異解析・BRAF V600 変異解析・RAS 遺伝子変異解析・サイトケラチン19mRNA生生殖殖細細胞胞系系列列遺遺伝伝子子検検査査::個体が生来的に保有する遺伝学的情報を明らかにする検査;原則的に生涯変化しない•定性解析•定量解析この検体、本当に陰性ですか?内内部部ココンントトロローールル((IICC))•PCR反応をモニターし、陰性判定の際にPCR阻害などによる失敗ではないことを確認•同一反応チューブ内で行われる陽性反応–人工的に添加した遺伝子ゲゲルル電電気気泳泳動動蛍蛍光光検検出出•ジェノタイピング(遺伝子型判定)•変異型の検出トラブル?遺伝子の基礎PCRの基礎リアルタイムPCRの基礎リリアアルルタタイイムムPPCCRRをを利利用用ししたた遺遺伝伝子子関関連連検検査査技技術術リアルタイムPCRの設計フローデジタルPCRとは•ジェノタイピング(遺伝子型判定)•変異型の検出PPCCRR増増幅幅のの様様子子ををリリアアルルタタイイムム検検出出遺伝子検出変異解析陰性?失敗?PPCCRR増増幅幅のの様様子子ををリリアアルルタタイイムム検検出出遺伝子検出39変異解析4340424446エエンンドドポポイインントトPPCCRRvvss..リリアアルルタタイイムムPPCCRRTable of contents遺遺伝伝子子関関連連検検査査へへのの応応用用リアルタイムPCRによる遺伝子解析エエンンドドポポイインントトPPCCRRvvss..リリアアルルタタイイムムPPCCRR遺遺伝伝子子関関連連検検査査遺遺伝伝子子関関連連検検査査へへのの応応用用リアルタイムPCRによる遺伝子解析定定性性解解析析内部コントロール(IC)243東京都医学検査 Vol. 53 No. 2
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